Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms