Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms