Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms