Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms