Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms