Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC12A4Q9UP95 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms