Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms