Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms