Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms