Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS6KB2Q9UBS0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms