Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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