Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms