Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTG1Q9NSN8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms