Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms