Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms