Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms