Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NRDE2Q9H7Z3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms