Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLMPQ9H6B4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLMPQ9H6B4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLMPQ9H6B4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLMPQ9H6B4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLMPQ9H6B4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms