Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1EQ9GZS1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.4 ms