Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.4 ms