Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms