Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms