Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms