Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms