Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms