Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms