Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms