Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms