Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms