Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms