Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms