Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCORQ96JN0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms