Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms