Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms