Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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