Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms