Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms