Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CSNK2A3Q8NEV1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CSNK2A3Q8NEV1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CSNK2A3Q8NEV1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CSNK2A3Q8NEV1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CSNK2A3Q8NEV1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CSNK2A3Q8NEV1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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