Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms