Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms