Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms