Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms