Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEXMIFQ5QGS0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms