Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms