Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms