Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms