Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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