Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms