Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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NRF1Q16656 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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NRF1Q16656 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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NRF1Q16656 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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NRF1Q16656 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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NRF1Q16656 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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NRF1Q16656 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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NRF1Q16656 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NRF1Q16656 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NRF1Q16656 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NRF1Q16656 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NRF1Q16656 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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