Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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